企業的商業秘密被侵犯，應視不同情況，分別向不同部門起訴，尋求司法保護 。
第一，向仲裁機構申請仲裁解決 。企業的商業秘密被侵犯，如果此前企業與侵權人之間簽訂了《合同》，并且雙方自愿達成仲裁協議的，可向約定的仲裁機構申請仲裁 。對仲裁裁決不服的，可以在十五日內向人民法院起訴 。
第二 ， 在雙方沒有約定仲裁管轄時，可以直接向人民法院起訴 。向人民法院起訴的 ， 要弄清人民法院的管轄范圍，一般講應向被告所住地人民法院或侵權行為地人民法院起訴 。
【商業秘密受侵犯該怎樣起訴】訂立合同的，應向被告所住地或合同履行地人民法院起訴 。
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